يعتبر التخلص من مياه الصرف الصحى من اكبر المشاكل فى المدن خاصة بعدما اتسعت الرقعة السكانية و اكتظت المدن بالسكان لا تزال كثير من الدول تلقى بمياه الصرف الصحى فى المسطحات المائية كالبحار و البحيرات و الانهار فالمدن التى تقع على الشواطئ البحار تلقى بفضلاتها فى هذه البحار , و من امثلة هذه المدن مرسيليا بفرنسا و مدينة الاسكندرية بمصر .
الاثار الضارة الناجمة عن تلوث المسطحات المائية بمياه الصرف الصحى يمكن تلخيصها فى الاتى
- تحتوى مياه الصرف الصحى على بكتريا كثيرة جدا تسبب هذه امراض كثير جدا و منها :
- بكتريا السالمونيا ( salmonella ) : التى تسب مرض التيفود و الحمة المعوية .
- بكتريا الشيجلا : التى تسبب الاسهال .
- بكتريا الاشرشيا كولاى : التى تسبب القئ و الاسهال ت وتؤدى الى الجفاف خاصة عند الاطفال .
- بكتريا البتوسبيرا : التى تسبب التى تسبب التهابات الكلى و الكبد و الجهاز العصبى المركزى .
- بكتريا الكوليرا : التى تسبب مرض الكوليرا .
و بذلك يتم انتقال الكثير من الامراض الخطرة بواسطة مياه المجارى الى البكتريا المسطحات المائية و تصبح مصدراللعدوى و تعيش انواع من هذه البكتريا فى مياه هذه المسطحات حيث تجد الغذاء متوافرا فى الفضلات و تتنفس من الاكسجين الذائب فى الماء و تنعم بضوء الشمس الساقط على هذه المسطحات المائية . ثم انتقل هذه البكتريا المعدنية الى الانسان اما عن طريق الجلد و الجروح و الفم عند السباحة فى هذه المياه أو عند تناول الاسماك و الكائنات البحرية المصابة . ومن المعروف أن مياه المجارى غنية جدا بالواد العضوية .
و ارتفاع نسبة المواد العضوية بالماء يؤدى الى زيادة عمليات التمثيل الغذائى ( الايض ) التى تقوم بها الطحالب , كما تنشط ايضا البكتريا و تزيد من عمليات التحلل البيولوجى للطحالب مما يؤدى الى تقليل نسبة الاكسجين المذاب فى الماء , ويترتب على ذلك قتل كميات كبيرة من الاسماك و الاحياء المائية و تتعفن المياه وتصدر منها روائح كريهة و تصبح غير صالحة للاستخدام و تعرف هذه الظاهرة عند علماء البيئة بظاهرة التشبع الغذائى . و تتمثل هذه الظاهرة فى كثير من المجارى المائية التى تزدادا فيها نسبة الغذائية بشكل كبير و تظهر بصفة خاصة فى البحيرات المقفلة , و يقال عندئذ ان البحيرات قد تقدمت بها السن ووصلت الى مرحلة لم تكن لتصل اليها فى الظروف المعتادة الا بعد انقضاء لالاف السنين حيث ينتهى الامر بهذه الانهار و البحيرات الى ان تتحول الى مستنقعلات تتشابك فيها البقايا النباتية . و تصعب فى الملاحة , وتصبح غير صالحة للصيد أو الاسترواح .
- لاحظ أن بقية الطحالب بسيطة ثم تبدأ فى التضخم بعد ذلك لاحظ أن طبقة الرواسب ايضا تبدأ بسيطة ثم تزيد بعد ذلك تموت الطحالب التى فى القاع و تتغذى عليها البكتريا التى تستهلك الاكسجين الموجود فى الماء و يموت السمك بسبب نقص الاكسجين . ولا شك ان معالجة مياه الصرف معالجة جيدة فبل القائها سيقلل من الضرر الناجمة عنها اذا ما ألقيت فى البحيرات , و لكن هذه المعاجة لا تستطيع تخليص مياه الصرف الصحى من بعض المواد الكيماوية الذاتية فيها مثل : مركبات الفوسفات و مركبات النترت , و بذلك فإن تركيزه هذه الاملاح فى مياه البحيرات والانهار سوف يساعد على نمو الطحالب و النباتات بشكل كثيف و تتحول فى النهايات الى مستنقعات .